Genomische bibliotheek versus cDNA-bibliotheek

Schrijver: Laura McKinney
Datum Van Creatie: 6 April 2021
Updatedatum: 10 Kunnen 2024
Anonim
cDNA library vs Genomic DNA library
Video: cDNA library vs Genomic DNA library

Inhoud

Genomische bibliotheek en cDNA-bibliotheek worden beide gebruikt bij genklonering om verschillende DNA's te isoleren. Het verschil tussen beide bibliotheken is dat de genomische bibliotheek DNA-fragmenten omvat die het hele genoom van een organisme tot expressie brengen, terwijl in de cDNA-bibliotheek mRNA uit bepaalde cellen van een organisme wordt genomen en cDNA vervolgens uit dit mRNA bestaat in een reactie die wordt gekatalyseerd door een enzym.


Inhoud: Verschil tussen Genomic Library en cDNA Library

  • Vergelijkingstabel
  • Wat is Genomic Library?
  • Wat is de cDNA-bibliotheek?
  • Belangrijkste verschillen

Vergelijkingstabel

BasisGenomische bibliotheekcDNA-bibliotheek
DefinitieEen genomische bibliotheek is een verzameling van het volledige genomische DNA van één organisme. DNA wordt opgeslagen in een populatie van vergelijkbare vectoren, die elk een afzonderlijke insert van DNA bevatten.Een cDNA-bibliotheek is een mengsel van gekloonde cDNA-fragmenten ingevoegd in een selectie van gastheercellen, die gezamenlijk een deel van het transcriptoom van het organisme vormen.
UitdrukkingHele genoomAlleen specifieke genen.
GroottegroterKleiner
intronenHuidigeAfwezig
VectorHet maakt gebruik van plasmiden, cosmide, lambda-faag, YAC en BAC voor de accommodatie van grote fragmenten.Het zijn geen introns, dus gebruikt het plasmiden, faagmiden en lambda-fagen om bescheiden fragmenten te herbergen.

Wat is Genomic Library?

In de genkloneringsprocedure wordt het gen van interesse gekopieerd van DNA gescheiden van een organisme. Wanneer DNA van een organisme wordt gescheiden, zijn de genen ervan in één keer geëxtraheerd. DNA van het organisme bestaat uit duizenden verschillende genen. Genetische ingenieur vindt één specifiek gen dat codeert voor het specifieke eiwit van interesse.


Er is absoluut geen enkele methode waarmee een bepaald gen uit DNA beschikbaar is, dus wetenschappers maken genenbibliotheken om het DNA van het organisme te catalogiseren. Wetenschappers, kies dan het gewenste gen in de bibliotheek. Genenbibliotheek is een groep levende bacteriekolonies die zijn getransformeerd met unieke stukjes DNA in het organisme dat de oorsprong is van het gewenste gen. DNA wordt gewonnen uit een organisme om een ​​bibliotheek te bouwen die een georganiseerde vorm van DNA is. Genomische bibliotheek en cDNA zijn twee soorten genbibliotheken. Talrijke technieken van genklonering zijn gebruikt als genstrategieën in recombinante technologie.

De DNA-fragmenten worden gescheiden door knippen met specifieke restrictie-enzymen van ouder-DNA. Deze fragmenten worden geligeerd aan vectormoleculen en de geaccumuleerde moleculen worden verplaatst naar gastheercellen, 1 molecuul in elke cel. De genomische bibliotheek bestaat uit introns, junk-DNA en een aantal andere fragmenten. Binnen deze bibliotheek wordt DNA opgedeeld in kleinere fragmenten in een cel. Hierna worden alle kleine onderdelen in een vector ingevoegd om een ​​bibliotheek te maken. De genomische bibliotheek omvat al het DNA van de hele genen en de cel bestaat uit al hun introns. Genomisch DNA is de vertaling van het hele genoom. Het codeert niet het hele deel op één codon vanwege de grootte van introns. Er is geen splicingmechanisme in een genomische bibliotheek dat problemen veroorzaakt bij de expressie van genen uit deze bibliotheek.


Wat is de cDNA-bibliotheek?

cDNA-bibliotheek wordt geconstrueerd door één weefsel- of celtype te kiezen. Vervolgens wordt mRNA uit dat weefsel of die cel geïsoleerd. Een DNA-kopie van het mRNA-molecuul bestaat uit een specifiek enzym reverse transcriptase-enzym. Dus de cDNA-bibliotheek bevat dat specifieke DNA dat aanwezig is in mRNA. Geen introns en geen DNA-sequentie worden gevonden in deze bibliotheek. Binnen deze bibliotheek zijn alle klonen van volledige lengte. Verder is een cDNA-kloon essentieel voor het transfecteren van cellen voor eiwitproductie of voor op cellen gebaseerde assays.

Belangrijkste verschillen

  1. De genomische bibliotheek werd rechtstreeks van het genomische DNA geschreven.
  2. cDNA-bibliotheek werd gevormd met behulp van mRNA als sjabloon.
  3. De genomische bibliotheek beslaat het gehele genoom van dit organisme.
  4. cDNA-bibliotheek vertegenwoordigt alleen genen van bepaalde aandoeningen.
  5. Twee enzymen, restrictie-endonucleasen en ligasen zijn belangrijk voor de constructie van de genomische bibliotheek.
  6. Het reverse transcriptase-enzym speelt een belangrijke rol bij de constructie van de cDNA-bibliotheek.
  7. De genomische bibliotheek bezet het DNA van zowel prokaryotische als eukaryotische organismen.
  8. cDNA-bibliotheek vertegenwoordigt het DNA van alleen eukaryote organismen.
  9. cDNA-bibliotheek is in staat tot genoomexpressie in prokaryotische bacteriën omdat ze introns missen.
  10. Een genomische bibliotheek kan dit niet zeggen in het prokaryotische organisme omdat ze introns hebben en het prokaryotische organisme geen machines heeft om introns te verwerken.